«Яндекс.Поиск» копирует стандартный многостраничный интерфейс iOS и содержит 6 экранов с отображением активного экрана черной точкой. По умолчанию открывается второй экран, показывающий информацию о погоде и биржевых котировках. А экраны с третьего по шестой содержат ярлыки к сервисам «Яндекса» и сторонним популярным ресурсам, включая «Вконтакте», «Одноклассники», Facebook, Twitter и «Википедию». Первый же экран, который по умолчанию остается слева, содержит историю запросов.

В настройках приложения ярлыки можно менять местами, удалять и добавлять собственные - на любые сайты. Можно указать, чтобы приложение пыталось запустить другое приложение вместо сайта. Например, если в iPhone установлены «Яндекс.Карты», то вместо сайта будет открываться именно приложение.

Для дополнительного удобства разработчики сделали так, чтобы в поисковую строку можно было вводить как запросы, так и адреса сайтов. Приложение автоматически определяет, что именно введено, и открывает страницу результатов поиска либо ресурс. Также можно указать, чтобы сайт автоматически открывался в Safari.